《生物信息學（第二版）》由16所985、211高校聯閤編寫而成，係統全麵地介紹瞭生物信息學的基本概念與內容。《生物信息學（第二版）》共12章，內容涵蓋分子生物學數據庫、DNA/氨基酸序列比對、基因結構與功能、蛋白質結構與功能、係統生物學、閤成生物學、計算生物學等生物信息學中的重點問題。第一章迴顧瞭生物信息學曆史，第二章介紹瞭分子生物學相關信息資源，第三章至第六章敘述瞭從序列比對分析到蛋白質結構預測再到基因組學、蛋白質組學的研究，第七章和第八章介紹瞭係統生物學與閤成生物學的研究內容及成果，第九章介紹瞭分子進化分析方法，第十章討論瞭統計學習與推理等基本知識，第十一章討論瞭生物信息學基本的編程基礎，第十二章敘述瞭第二代測序技術的基本概念與分析應用。新版配有大量二維碼，方便讀者進行互聯網瀏覽與查詢。

作者簡介

陳銘，浙江大學教授，2004年畢業於德國比勒菲爾德大學生物信息學係，獲博士學位。2005年迴國任教，浙江大學生物信息學學科帶頭人，擔任浙江省生物信息學學會理事長，中國運籌學會計算係統生物學分會常務理事，中國細胞生物學學會功能基因組信息學與係統生物學分會理事，中國醫藥生物技術協會生物醫學信息技術分會委員會委員等。

內頁插圖

目錄
序
第二版前言
第一版前言
第一章生物信息學的概念及其發展曆史 1
第一節生物信息學的發展曆史 1
第二節生物信息學的研究領域 4
第三節生物信息學的主要應用 5
第四節生物信息學麵臨的挑戰 9
思考題 10
參考文獻 10
第二章生物學數據庫及其檢索 11
第一節生物學數據庫簡介 11
第二節生物學數據庫的內容與結構 19
第三節生物學數據庫的檢索 30
思考題 41
參考文獻 41
第三章序列比對原理 42
第一節序列比對相關概念 42
第二節序列比對打分方法 46
第三節序列比對算法 51
第四節序列比對工具 55
第五節多序列比對 58
思考題 62
參考文獻 62
第四章蛋白質結構預測與分析 64
第一節蛋白質結構組織層次 64
第二節蛋白質結構的測定與理論預測 70
第三節蛋白質對接 84
第四節蛋白質摺疊與疾病 85
思考題 89
參考文獻 89
第五章真核生物基因組的注釋 90
第一節蛋白質編碼基因的注釋 90
第二節 RNA基因的注釋 95
第三節重復序列的注釋 96？？
第四節假基因的注釋 97
第五節案例分析：黃瓜基因組的注釋 98
思考題 106
參考文獻 106
第六章蛋白質組學 108
第一節蛋白質組學概述 108
第二節蛋白質的大規模分離鑒定技術 112
第三節蛋白質的翻譯後修飾 117
第四節蛋白質分選 118
第五節蛋白質相互作用 120
思考題 126
參考文獻 126
第七章係統生物學 128
第一節係統生物學基本概念 128
第二節係統生物學基本技術與方法 132
第三節先進的成像技術 135
第四節基因錶達調控網絡 140
第五節代謝網絡 143
第六節信號轉導途徑 146
第七節蛋白質蛋白質相互作用網絡 154
第八節虛擬細胞 164
思考題 164
參考文獻 165
第八章閤成生物學 169
第一節閤成生物學概述 169
第二節閤成生物學基礎研究經典實例 172
第三節閤成生物學應用研究經典實例 178
思考題 181
參考文獻 181
第九章分子進化與係統發育 183
第一節分子進化與係統發育 183
第二節分子係統發育樹的構建方法 188
第三節係統發育樹構建及應用 199
思考題 213
參考文獻 213
第十章統計學習與推理 216
第一節統計學習與推理基礎 216
第二節統計模型與參數推斷 220
第三節聚類分析、主成分分析與Fisher判彆 223
第四節貝葉斯推理 228
第五節隱馬爾可夫模型 230
第六節動態神經網絡 237
第七節支持嚮量機 241
第八節 MATLAB的應用實例 245
思考題 249
參考文獻 249
第十一章生物信息學編程基礎 250
第一節 Linux操作係統 250
第二節生物信息學中的編程語言 253
第三節 SQL及數據庫編程 268
第四節並行計算 279
思考題 286
參考文獻 287
第十二章第二代測序技術及其應用 288
第一節測序技術概述 288
第二節第二代測序原理 289
第三節第二代測序技術的應用 295
第四節生物信息學在第二代測序中的應用 298
思考題 304
參考文獻 305
彩版