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編輯推薦

適讀人群 ：可用作高等院校生物信息學課程的教材，科研院所相關專業學生、研究人員
　　生物信息學是21世紀生命科學*具潛力的學科，麵對海量的生物大數據，如何發掘齣新的知識和規律？這本書作為生物信息學的入門級專業教材，能幫助讀者迅速熟悉生物信息學的研究領域及常用的研究方法。

內容簡介

《生物信息學（第二版）》由16所985、211高校聯閤編寫而成，係統全麵地介紹瞭生物信息學的基本概念與內容。《生物信息學（第二版）》共12章，內容涵蓋分子生物學數據庫、DNA/氨基酸序列比對、基因結構與功能、蛋白質結構與功能、係統生物學、閤成生物學、計算生物學等生物信息學中的重點問題。第一章迴顧瞭生物信息學曆史，第二章介紹瞭分子生物學相關信息資源，第三章至第六章敘述瞭從序列比對分析到蛋白質結構預測再到基因組學、蛋白質組學的研究，第七章和第八章介紹瞭係統生物學與閤成生物學的研究內容及成果，第九章介紹瞭分子進化分析方法，第十章討論瞭統計學習與推理等基本知識，第十一章討論瞭生物信息學基本的編程基礎，第十二章敘述瞭第二代測序技術的基本概念與分析應用。新版配有大量二維碼，方便讀者進行互聯網瀏覽與查詢。

作者簡介

陳銘，浙江大學教授，2004年畢業於德國比勒菲爾德大學生物信息學係，獲博士學位。2005年迴國任教，浙江大學生物信息學學科帶頭人，擔任浙江省生物信息學學會理事長，中國運籌學會計算係統生物學分會常務理事，中國細胞生物學學會功能基因組信息學與係統生物學分會理事，中國醫藥生物技術協會生物醫學信息技術分會委員會委員等。

內頁插圖

目錄

目錄
序
第二版前言
第一版前言
第一章 生物信息學的概念及其發展曆史 1
第一節 生物信息學的發展曆史 1
第二節 生物信息學的研究領域 4
第三節 生物信息學的主要應用 5
第四節 生物信息學麵臨的挑戰 9
思考題 10
參考文獻 10
第二章 生物學數據庫及其檢索 11
第一節 生物學數據庫簡介 11
第二節 生物學數據庫的內容與結構 19
第三節 生物學數據庫的檢索 30
思考題 41
參考文獻 41
第三章 序列比對原理 42
第一節 序列比對相關概念 42
第二節 序列比對打分方法 46
第三節 序列比對算法 51
第四節 序列比對工具 55
第五節 多序列比對 58
思考題 62
參考文獻 62
第四章 蛋白質結構預測與分析 64
第一節 蛋白質結構組織層次 64
第二節 蛋白質結構的測定與理論預測 70
第三節 蛋白質對接 84
第四節 蛋白質摺疊與疾病 85
思考題 89
參考文獻 89
第五章 真核生物基因組的注釋 90
第一節 蛋白質編碼基因的注釋 90
第二節 RNA基因的注釋 95
第三節 重復序列的注釋 96？？
第四節 假基因的注釋 97
第五節 案例分析：黃瓜基因組的注釋 98
思考題 106
參考文獻 106
第六章 蛋白質組學 108
第一節 蛋白質組學概述 108
第二節 蛋白質的大規模分離鑒定技術 112
第三節 蛋白質的翻譯後修飾 117
第四節 蛋白質分選 118
第五節 蛋白質相互作用 120
思考題 126
參考文獻 126
第七章 係統生物學 128
第一節 係統生物學基本概念 128
第二節 係統生物學基本技術與方法 132
第三節 先進的成像技術 135
第四節 基因錶達調控網絡 140
第五節 代謝網絡 143
第六節 信號轉導途徑 146
第七節 蛋白質蛋白質相互作用網絡 154
第八節 虛擬細胞 164
思考題 164
參考文獻 165
第八章 閤成生物學 169
第一節 閤成生物學概述 169
第二節 閤成生物學基礎研究經典實例 172
第三節 閤成生物學應用研究經典實例 178
思考題 181
參考文獻 181
第九章 分子進化與係統發育 183
第一節 分子進化與係統發育 183
第二節 分子係統發育樹的構建方法 188
第三節 係統發育樹構建及應用 199
思考題 213
參考文獻 213
第十章 統計學習與推理 216
第一節 統計學習與推理基礎 216
第二節 統計模型與參數推斷 220
第三節 聚類分析、主成分分析與Fisher判彆 223
第四節 貝葉斯推理 228
第五節 隱馬爾可夫模型 230
第六節 動態神經網絡 237
第七節 支持嚮量機 241
第八節 MATLAB的應用實例 245
思考題 249
參考文獻 249
第十一章 生物信息學編程基礎 250
第一節 Linux操作係統 250
第二節 生物信息學中的編程語言 253
第三節 SQL及數據庫編程 268
第四節 並行計算 279
思考題 286
參考文獻 287
第十二章 第二代測序技術及其應用 288
第一節 測序技術概述 288
第二節 第二代測序原理 289
第三節 第二代測序技術的應用 295
第四節 生物信息學在第二代測序中的應用 298
思考題 304
參考文獻 305
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前言/序言

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