| 图书基本信息 | |||
| 图书名称 | 分子动力学模拟的理论与实践 | 作者 | 严六明,朱素华 |
| 定价 | 85.00元 | 出版社 | 科学出版社有限责任公司 |
| ISBN | 9787030373595 | 出版日期 | 2018-04-01 |
| 字数 | 页码 | 256 | |
| 版次 | 32 | 装帧 | 平装 |
| 开本 | 16开 | 商品重量 | 0.400Kg |
| 内容简介 | |
| 分子动力学模拟是近年来飞速发展的一种分子模拟方法,它以经典力学、量子力学、统计力学为基础,通过计算机数值求解分子体系运动方程的方法,模拟研究分子体系的性质。目前,分子模拟已经成为继实验和理论研究方法之后,研究分子体系性质的第三种研究方法,被广泛用于化学、化工、生物、医药、材料科学、物理等领域。全书容分为三个部分:㈠介绍分子的物理模型,分子间相互作用,以及常用的分子力场。㈡介绍分子动力学模拟的基本原理与方法,包括分子体系运动方程的数值解方法、分子动力学模拟方法的理论基础等。㈢介绍常用的分子动力学模拟算法和技巧,模拟结果的分析与讨论。考虑到与分子动力学模拟有关的文献中理论框架、术语、符号等的不统一给读者带来的不便,本书将以分子的物理模型、分子动力学模拟的理论基础、模拟结果的分析与讨论这样的框架介绍分子动力学模拟。同时,本书将努力建立一套统一的术语和符号,以期给读者*的方便。 |
| 作者简介 | |
| 目录 | |
| 编辑推荐 | |
| 文摘 | |
| 序言 | |
这本书的排版风格,说实话,有点“老派”,可能不太符合当下追求极简主义的审美。字体和图表的清晰度倒是无可挑剔,但整体的版式设计略显拥挤,尤其是那些复杂的公式占据了大量的空间,使得一页的内容信息量极大,读起来需要高度集中注意力。不过,一旦你适应了这种风格,你会发现这种密集的排版恰恰是其专业性的体现——没有多余的“注水”,全是干货。我尤其喜欢它在介绍高级算法,比如各种积分器的改进版本时,会用对比的方式列出它们在精度和计算效率上的优劣权衡。这培养了一种批判性思维,让你明白没有“万能”的模拟方法,只有最适合特定问题的工具。这种客观公正的评价体系,让读者能够基于科学的考量而不是盲目的跟风去选择算法。这本书的价值在于“教你如何思考”,而不是简单地“告诉你答案”。即便是已经工作几年的人,翻阅其中关于平衡态与非平衡态模拟交叉地带的章节,也依然能找到新的启发点,这本“老书”的生命力确实很强。
评分说实话,我拿到这本书的时候,是带着一种既期待又略微忐忑的心情。期待的是能找到一本真正能系统梳理分子模拟体系构建难点的权威著作,忐忑的是担心内容过于晦涩难懂,毕竟“理论与实践”四个字的分量可不轻。幸运的是,作者在处理“实践”部分时,展现出了一种非常贴近实际操作的智慧。书中对于如何选择合适的模拟时间尺度、如何处理周期性边界条件带来的影响,以及在进行自由能计算时需要注意的陷阱,都有非常细致的描述。这些都不是教科书上泛泛而谈的理论概念,而是真正在跑模拟时会遇到的“拦路虎”。我尝试按照书中的建议去调整我的系统参数,结果发现模拟的收敛速度和结果的稳定性都有了肉眼可见的提升。这种“手把手”的指导感,让这本书的价值远远超出了单纯的理论阐述。它更像是一位资深研究员在自己的经验总结中,悄悄为你点亮了前方的迷雾。对于正在做毕业设计或者刚进入实验室的新人来说,这本书的实战价值是无可替代的。
评分这本厚重的教材,封面设计得非常朴实,一看就是那种面向专业学习者的硬核读物。我花了一段时间才啃完第一遍,感觉收获颇丰,尤其是在理解那些复杂的物理图像和数学推导方面,作者的讲解确实下了很大功夫。它不像市面上很多流行的科普读物那样追求阅读的轻松愉快,而是直击核心,每一个公式的推导都力求严谨清晰,让人不得不佩服作者深厚的学术功底。这本书的结构安排也很有章法,从基础的统计力学原理回顾,到各种力场构建的细节,再到模拟算法的实现,逻辑链条非常完整。我特别欣赏它在讲解蒙特卡洛方法和分子动力学方法的区别与联系时所采取的对比视角,这有助于初学者构建起全局观,而不是孤立地看待这些工具。虽然阅读过程中需要时常查阅其他参考书来辅助理解一些前置的数学知识,但这本书本身提供的知识密度和深度,足以支撑起一个完整的学习框架。对于有志于在计算化学或材料模拟领域深入研究的人来说,这绝对是一本值得反复研读的案头必备书。它不仅仅是一本介绍软件操作的手册,更是对整个模拟方法背后的理论精髓进行了一次彻底的剖析。
评分这本《分子动力学模拟的理论与实践》在我书架上占了不小的位置,它几乎成了我处理复杂计算问题的“第一参考书”。与其说它是一本书,不如说它是一个经过时间检验的知识库。我发现它在涉及时间序列分析和数据后处理的部分处理得特别到位。很多初学者往往把精力都放在如何“跑出”轨迹文件上,却忽略了如何从海量数据中提取有意义的物理量。书中详细介绍了傅里叶变换、自相关函数计算以及如何有效进行采样统计以保证结果的显著性。这些内容对于想将模拟结果发表在高水平期刊上的研究者来说,是至关重要的“临门一脚”。它的语言风格虽然严谨,但逻辑层次分明,即便是跨学科背景的读者,只要具备基本的微积分基础,也能沿着作者的思路前进。这本书带来的最大财富,或许是让我明白了,分子模拟并非是简单的数值计算,它是一门将严谨的物理定律、高效的数值算法和对实际体系深刻洞察力完美融合的综合性科学艺术。
评分我是在一个寒冷的冬夜开始系统阅读这本著作的,窗外雪花纷飞,屋内暖气充足,配上这样一本需要静心研读的书籍,感觉非常契合。这本书最让我感到震撼的,是它在宏大叙事之下,对微观世界细节的极致捕捉。作者对于如何准确地描述分子间的相互作用力,也就是力场的选择与参数化,进行了近乎“哲学思辨”层面的探讨。比如,在处理溶剂化作用时,书里不仅讲解了显式和隐式溶剂模型的数学基础,还深入分析了每种模型在处理界面效应时的内在局限性。这种对“局限性”的坦诚揭示,是衡量一本科学著作是否成熟的重要标志。它没有过度美化分子模拟的强大,而是让读者清醒地认识到,模拟结果的可靠性,最终还是受制于我们对真实世界物理化学过程理解的深度。读完相关章节后,我对以往快速搭建模型的随意性感到羞愧,开始更加审慎地对待每一个输入参数的物理意义,这无疑是一次巨大的思维升级。
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