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内容简介

　　计算机辅助药物设计已成为一门新兴的研究领域，在合理药物设计中发挥不可或缺的作用。
　　《常用计算机辅助药物设计软件教程》依据实际工作中各种软件的应用，介绍了分子动力学模拟、分子对接、蛋白质同源模建、定量构效关系的研究、药效团的构建、虚拟筛选等内容，且每一内容有不止一个软件的使用介绍，适合入门计算机辅助药物设计的广大师生参考使用。

内页插图

目录

第一章 同源模建法预测蛋白质结构
第一节 同源模建概述
第二节 同源模建

第二章 分子对接预测结合位点
第一节 利用AutoDock进行分子对接
第二节 利用D0CK进行分子对接
第三节 利用Surflex-Dock进行分子对接
第四节 利用GOLD进行分子对接

第三章 蛋白质与核酸的分子动力学模拟
第一节 分子动力学概述
第二节 利用GROMACS进行纯蛋白分子动力学模拟
第三节 蛋白与小分子复合物的动力学模拟
第四节 核酸分子动力学模拟

第四章 利用OpenEye组件包进行虚拟筛选
第一节 软件简介
第二节 利用OpenEye组件包进行虚拟筛选

第五章 定量构效关系分析
第一节 CoMFA&CoMSIA;
第二节 HQsAR

第六章 药效团
第一节 药效团介绍
第二节 利用Discovery Studio进行药效团模型构建

第七章 全新药物设计
第一节 概述
第二节 利用LigBuilder进行全新药物设计

第八章 作图软件PyMOL的应用
第一节 PyMOL简介
第二节 PyMOL基本操作

第九章 药物设计实例
第一节 利用OpenEye发现F．tularensis烯酰基载体蛋白还原酶FabI抑制剂
第二节 基于模建结构的虚拟筛选发现对虾黄头病毒蛋白酶抑制剂
第三节 基于药效团建模和分子对接的虚拟筛选发现？-分泌酶抑制剂
参考文献
彩图

前言/序言

　　从20世纪90年代开始，随着计算机技术的迅速发展以及药物化学、分子生物学和计算化学的发展，计算机辅助药物设计（CADD）也快速发展起来，成为一门新兴的研究领域。与此同时，CADD的发展和应用，也大大促进了药物设计和新药开发的效率，CADD现在已经成为合理药物设计中不可或缺的一环，在药物设计中起着越来越重要的作用。因此，CADD方法的理论和应用研究具有非常重要的意义。关于CADD的理论，很多教科书和专著已进行大量介绍，适合初学者学习理论知识，但是在实际中的操作，却鲜有基础书目可以参考。本书编者长期从事相关工作，根据在实际工作中对各种软件的应用，编写了本书，介绍计算机辅助药物设计时需要用到的部分软件的使用，以实现设计目的为导向，着重介绍软件的操作方法，使用过程中的细节与原理，可以使初学者迅速入门。本书内容包含了分子动力学模拟、分子对接、蛋白质同源模建、定量构效关系的研究、药效团的构建、虚拟筛选等内容，且每一内容有不止一个软件的使用介绍，希望能对入门计算机辅助药物设计的广大师生有所帮助。
　　本书的编写是从初学者的角度，手把手、一步一步介绍各软件的使用方法、功能，并配有图片，使初学者能够顺利学习。使用各种常用软件。
　　限于编者的水平有限，书中可能存在不妥之处，敬请广大读者批评和指正。
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评分☆☆☆☆☆

本校老师编写的

评分☆☆☆☆☆

这本书的主编是北京大学药学院的张亮仁教授，一位业内很知名的药物化学家。这本书详细介绍了很多相关软件的操作方法，比如Autodock, GOLD, OpenEye,DS,Pymol等软件。操作步骤介绍得很详细。是一本很好的书。

评分☆☆☆☆☆

内容很新很好，包装精良，赞一个！

评分☆☆☆☆☆

正好在学习这些内容。工作了才知道，无处不在的竞争压力让这些基本的知识技能变成了难以获得的稀缺资源，自学是件非常辛苦的事情，感谢作者详尽阐述每一个细节，每一个知识点，非常及时的一本书！

评分☆☆☆☆☆

常用计算机辅助药物设计软件教程

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专业用书，内容还可以，纸张有点差

评分☆☆☆☆☆

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好书。

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