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内容简介

　　《华大基因国家基因库系列：生物信息数据库建设、使用与管理指南》先从整体上对国内外生物信息数据库进行整体的概述。从数据来源、数据类型、生物数据分析方法、生物信息分析平台等方面探讨如何对生物数据库的数据进行管理，包括数据采集、数据存储、备份和恢复等。然后介绍了数据库设计的方法、原则及常见生物信息数据库的特点并以NCBI为例介绍了数据库如何提交数据、检索数据等。最后探讨了数据库的伦理学及知识产权保护问题。

目录

前言第一篇 生物信息数据库概述1 生物信息数据库1.1 生物信息数据库概述1.2 生物信息数据库的分类2 国内外生物信息数据库的发展2.1 国际生物信息数据库的发展2.2 中国的生物信息数据库建设2.3 建设生物信息数据库：存在的问题和解决思路探讨
第二篇 用于建立生物信息数据库的数据管理3 数据来源3.1 从各种生物信息数据库的FTP下载3.2 各种生物信息数据库的查询结果3.3 各实验终端提供的数据4 数据类型4.1 原始数据4.2 生物信息分析数据5 生物信息分析平台5.1 生物信息分析平台简介5.2 Galaxv平台5.3 GenePattel—n生物分析平台5.4 DNAnexus生物分析平台5.5 Blast forneKP Project6 数据质量管理规范6.1 数据质量概述6.2 生物数据的质量控制7 数据存储管理7.1 存储内容7.2 大数据存储7.3 存储方式7.4 存储管理一般原则8 数据备份和恢复管理规范8.1 数据的备份8.2 数据的恢复9 数据安全管理规范9.1 数据分类9.2 权限管理9.3 注意事项
第三篇 建立生物信息数据库的实用指南10 概述10.1 引言10.2 数据相关的基本概念11 数据库设计11.1 数据库设计过程11.2 数据库设计规范（以关系数据库为例）11.3 数据库命名规范12 常见生物信息数据库特点12.1 数据模型12.2 数据库的存储13 生物信息数据库系统开发13.1 虚拟本地数据库13.2 本地数据库
第四篇 生物信息数据库的使用管理规范14 数据库的安全性管理14.1 安全性的类型14.2 数据库安全性控制方法14.3 基于角色访问控制的安全性和权限管理15 数据提交管理15.1 概述15.2 提交内容15.3 提交方式16 数据共享和交互17 数据检索17.1 检索工具17.2 检索结果格式j
第五篇 伦理学问题18 国际伦理法则19 生物大数据中的伦理问题20 国内生物信息数据库中的伦理问题21 伦理规范21.1 伦理的原则21.2 关于知情同意22 伦理审查建设22.1 公开透明的政策和社会广泛参与22.2 信息的处理（保密和告知研究结果）应以参与者利益为重22.3 建立有效的监督和责任机制22.4 加强伦理审查能力建设
第六篇 生物信息数据库知识产权保护23 引言24 国内外数据库权利保护相关条约、协议24.1 欧盟数据库法律保护24.2 美国数据库法律保护24.3 WIP0数据库法律保护24.4 我国数据库法律保护现状25 生物信息数据库的保护模式探讨25.1 存在的问题25.2 生物信息数据库知识产权保护建议
参考文献缩略语表名词术语

前言/序言

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