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編輯推薦

適讀人群 ：生物學科研究生、高年級本科生和相關領域的科研工作作者。
　　1.內容全麵係統，包括分子係統發生學的基礎、原理、方法、應用。2. 指導性強，可作為相關研究的工具書；3. 語言簡潔、通俗易懂，可讀性強。

內容簡介

　　分子係統發生學是應用分子數據重建係統發生關係的學科。《分子係統發生學》全麵係統地論述瞭分子係統發生學的基礎、原理、方法及應用。《分子係統發生學》由18章組成，可以歸納為五大部分：第一部分包括第1～3章，分彆介紹瞭係統發生和係統樹的基本知識；第二部分包括第4～7章，是分子係統發生分析的基礎，其中第4章和第5章是分子係統發生學的信息學基礎，第6章是數據集係統發生信號評估，第7章討論瞭分子進化模型及模型選擇原理與方法；第三部分中的第8～12章是各種係統發生分析方法，分彆就目前主要的係統發生分析方法（距離矩陣法、簡約法、貝葉斯推論法和係統發生網絡法等）從原理、軟件操作、應用及局限性等方麵進行瞭詳細的介紹，第13章討論瞭係統發生假設檢驗的原理和方法，第14章討論瞭係統發生分析可靠性與影響因素；第四部分主要涉及各類數據集分析策略，其中第15章總結瞭不同類型數據的分析策略，第16章對復雜數據係統發生的分析策略與方法進行瞭詳細地介紹，第17章是多基因數據分析策略和方法；最後一部分即第18章是係統樹的可視化、注釋與應用方麵的內容。
　　《分子係統發生學》可作為生物學、生物技術、生態學和生物信息學專業的本科生、研究生及科研人員學習分子係統發生學的教材或參考資料。

作者簡介

黃原：陝西師範大學教授，主要從事昆蟲的分子進化和分子係統學、綫粒體基因組學、比較及進化基因組學等方嚮的研究。陝西科技進步一等奬獲得者。

目錄

前言
第1章 係統發生學概論
1.1 係統發生與係統發生學
1.2 係統發生關係的含義
1.2.1 錶徵關係
1.2.2 分支關係
1.2.3 遺傳關係
1.2.4 係統發生關係
1.2.5 年代關係
1.2.6 地理分布關係
1.3 分子係統發生分析的原理和假設
1.3.1 分子係統發生分析的原理
1.3.2 分子係統發生分析的假設
1.3.3 分子數據的優點
1.4 分子係統發生學的方法論
1.5 分子係統發生學的發展曆史
1.6 係統發生分析的策略與步驟
1.7 分子係統發生學的文獻資源
1.7.1 分子係統發生學期刊
1.7.2 分子係統發生學領域主要專著和教科書
1.8 分子係統發生學的成就和問題

第2章 係統發生分析基礎
2.1 分子進化基礎
2.1.1 分子進化的動力
2.1.2 分子進化的中性理論
2.1.3 溯祖理論
2.2 係統發生分析的分類學基礎
2.2.1 係統發生與分類學的關係
2.2.2 分類階元的係統發生意義
2.3 性狀和性狀分析方法
2.3.1 性狀的分類
2.3.2 關於性狀的基本假設
2.3.3 性狀進化分析方法
2.3.4 性狀的加權
2.3.5 性狀的同源
2.3.6 性狀的同型
2.4 係統發生分析的數學基礎
2.5 係統發生分析的統計學基礎
2.5.1 概率分布
2.5.2 係統發生的統計學檢驗
2.5.3 零假設與零模型
2.5.4 常用檢驗方法
2.5.5 隨機數據及其在係統發生中的應用
2.6 理論係統發生學
2.7 模擬係統發生研究
2.7.1 係統樹的模擬
2.7.2 序列的模擬
2.7.3 係統發生模擬研究的優勢
2.8 係統發生分析的算法
2.8.1 精確算法
2.8.2 啓發式算法

第3章 係統樹
3.1 係統樹的概念和含義
3.2 係統樹的要素
3.2.1 係統樹的拓撲結構
3.2.2 係統樹的節點
3.2.3 係統樹的分枝和分枝長度
3.3 演化曆史與係統樹的完整性
3.4 係統樹錶達的信息
3.5 係統樹概念和錶達形式的發展
3.6 係統樹的類型
3.6.1 樹狀圖與網狀圖
3.6.2 有根樹和無根樹
3.6.3 標度樹與未標度樹
3.6.4 基因樹和物種樹
3.6.5 基礎樹和閤一樹、源樹和超樹
3.6.6 期望樹與實際樹
3.6.7 普適生命樹與完全樹
3.6.8 二歧樹和多歧樹
3.6.9 係統樹的錶示形式
3.7 係統樹的數學描述
3.7.1 係統樹各部位的名稱
3.7.2 二分樹及其錶示方式
3.7.3 二歧樹的性質
……

第4章 係統發生信息學
第5章 數據集準備與序列比對
第6章 數據集係統發生信號評估
第7章 進化模型及其選擇
第8章 距離矩陣方法
第9章 簡約法
第10章 最大似然法
第11章 貝葉斯係統發生推論法
第12章 係統發生網絡、超樹和無比對方法
第13章 係統發生假設檢驗
第14章 係統發生分析的可靠性與影響因素
第15章 不同類型數據的分析策略
第16章 復雜數據和睏難係統發生的分析策略與方法
第17章 多源數據集分析策略和方法
第18章 係統樹的可視化、注釋與應用
參考文獻
彩圖

前言/序言

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