玉米品种DNA指纹鉴定技术:SSR标记的研究与应用

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王凤格,赵久然 编
图书标签:
  • 玉米
  • DNA指纹
  • SSR标记
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  • 育种
  • 玉米遗传学
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出版社: 中国农业科学技术出版社
ISBN:9787511603883
版次:1
商品编码:11342662
包装:平装
开本:16开
出版时间:2011-01-01
用纸:胶版纸
页数:264
正文语种:中文

具体描述

内容简介

  《玉米品种DNA指纹鉴定技术:SSR标记的研究与应用》主要内容包括:玉米种子质量鉴定技术的发展、玉米品种DNA指纹鉴定标准试验体系的建立、核心引物的筛选确定及多重电泳系统的建立等。

内页插图

目录

第一章 玉米种子质量鉴定技术的发展
第一节 玉米种子质量及种子质量检测的重要性
第二节 主要的种子鉴定技术
一、常规鉴定技术
二、现代鉴定技术
第三节 分子技术在玉米品种鉴定中的发展趋势
一、从RAPD标记到SSR标记的技术提升
二、从SSR标记到SNP标记的技术探索
三、从非功能标记向功能标记的转变
第二章 玉米品种DNA指纹鉴定标准试验体系的建立
第一节 DNA提取方法的研究
一、DNA提取的基本方法及原理
二、DNA快速提取方法研究——碱煮法
三、高质量DNA提取方法研究——改良高盐低pH法
四、果皮组织DNA提取方法研究
第二节 PCR扩增反应程序和反应体系的研究
一、通用PCR扩增反应程序的建立
二、多重PCR扩增体系的建立
第三节 电泳检测方法的研究
一、主要电泳检测方法的比较
二、PAGE/快速银染检测法的研究
三、毛细管电泳多色荧光检测与变性PAGE电泳银染检测两种检测方法的比较
四、毛细管电泳荧光检测中的异常电泳类型及原因分析
第三章 核心引物的筛选确定及多重电泳系统的建立
第一节 玉米DNA指纹鉴定中核心引物组合法的确立
一、特征谱带法、引物组合法和核心引物组合法的概念
二、特征谱带法、引物组舍法和核心引物组合法的比较研究
第二节 玉米通用SSR核心引物筛选
一、研究目的
二、研究思路
三、100个核心引物筛选的详细步骤
四、核心引物的重新设计
五、荧光多重PGR组合的建立
第三节 建库核心引物的确定及多重电泳系统的建立
第四章 玉米DNA指纹库数据统计及建库标准化规范
第一节 DNA指纹库数据的统计
一、建库SSR引物基本信息
二、原始数据统计记录方式
三、原始数据导人数据库的方式
第二节 玉米DNA指纹数据库建库标准化规范的建立
一、标记方法及标记来源
二、检测平台
三、试剂质量保证
四、样品的来源及性质
五、引物及流程的评估
六、不同来源数据的有效整合
七、拘建品种DNA指纹模式库
八、构建品种DNA指纹扩展库
九、数据库数据的随机盲测
第五章 玉米DNA指纹数据库管理系统的建立
第一节 数据信息表的整理
一、信息类资料
二、数据类资料
三、图片类资料
第二节 分析功能的没计及实现
一、主要功能及定义
二、品种查询比较功能的设计
三、亲子鉴定功能的设计
四、品种指纹图谱绘制功能的设计
五、一致性鉴定功能的设计
六、纯度鉴定功能的设计
第三节 网站用户权限分类及设计
第四节 未来发展战略规划
一、建立玉米DNA指纹国际联合数据库厦管理系统
二、建立DNA指纹数据库、分子标记辅助育种、单倍体育种技术三位一体的高效玉米育种技术体系
……

前言/序言


《玉米品种DNA指纹鉴定技术:SSR标记的研究与应用》 内容简介: 本书深入探讨了玉米品种DNA指纹鉴定技术,重点聚焦于SSR(Simple Sequence Repeat,简单重复序列)标记的研究与应用。随着现代农业的飞速发展,对作物种质资源的准确鉴定、品种纯度检测以及知识产权保护的需求日益迫切。SSR标记作为一种高效、稳定且信息量丰富的DNA标记技术,在玉米品种的分子鉴定中展现出了独特的优势。 本书旨在系统性地梳理SSR标记在玉米DNA指纹鉴定中的理论基础、实验操作、数据分析方法及其在实际应用中的案例。全书结构清晰,内容详实,既面向从事分子育种、种质资源管理、种子质量检测等领域的科研人员和技术人员,也适合对作物分子鉴定技术感兴趣的研究生及相关专业学生。 第一部分:SSR标记的理论基础与技术原理 本部分将首先回顾DNA指纹鉴定的基本概念和重要性,阐述其在农业生产和科研中的关键作用。随后,将详细介绍SSR标记的分子生物学原理。SSR是基因组中由少量核苷酸单位(通常2-6个碱基)串联重复组成的序列,其重复次数在不同个体或不同品种之间存在多态性。这种多态性源于DNA复制过程中的滑链现象和错配修复机制。 本书将深入解析SSR标记的特点,包括其高多态性、多等位基因、共显性以及在基因组中的广泛分布等。我们将详细介绍SSR标记的类型,如微卫星(microsatellites)和短串联重复序列(short tandem repeats)。 在技术原理方面,我们将重点阐述SSR标记的检测流程。这通常涉及DNA的提取与纯化、PCR(Polymerase Chain Reaction,聚合酶链式反应)扩增、产物分析等关键步骤。PCR扩增是SSR标记技术的核心,我们将详细介绍SSR引物的选择原则、设计方法以及PCR反应条件的优化策略,以获得高质量、高特异性的扩增产物。产物分析是SSR标记的关键环节,本书将重点介绍基于凝胶电泳(包括聚丙烯酰胺凝胶电泳和琼脂糖凝胶电泳)和毛细管电泳的SSR数据获取方法。我们将详细阐述不同电泳平台的优缺点,以及如何通过这些技术实现SSR位点长度的分辨和检测。 第二部分:SSR标记在玉米品种DNA指纹鉴定中的实践 本部分将聚焦于SSR标记在玉米品种DNA指纹鉴定中的具体应用。我们将详细介绍玉米基因组SSR位点的特点,包括其在基因组中的分布规律、重复单位的类型以及不同重复单位长度的多态性情况。 在实验操作方面,本书将提供详细的实验方案和技术指导。这包括: DNA提取方法: 介绍适用于不同玉米材料(如种子、叶片、根系等)的高效DNA提取试剂盒和传统方法,强调DNA质量和纯度对后续PCR扩增的影响。 SSR引物的设计与筛选: 详细讲解如何根据玉米基因组信息(如数据库、已发表的研究)设计特异性高、多态性丰富的SSR引物。我们将介绍常用的引物设计软件和策略,并指导读者如何进行引物的初步筛选和验证。 PCR扩增优化: 详细阐述影响PCR扩增效率和特异性的关键因素,包括DNA模板浓度、引物浓度、dNTPs浓度、MgCl2浓度、退火温度和循环次数等。我们将提供一套系统性的PCR条件优化流程,帮助读者获得最佳扩增效果。 SSR产物电泳分析: 详细介绍基于聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)和毛细管电泳(CE)的SSR产物分析技术。对于PAGE,我们将详细讲解凝胶配制、电泳缓冲液选择、上样技术、染色与成像方法。对于CE,我们将重点介绍其原理、仪器设置、电泳缓冲液和染料的选择,以及如何获取高分辨率的SSR图谱。 数据采集与图谱解读: 详细讲解如何从凝胶电泳或毛细管电泳图像中准确地读取SSR扩增条带的长度,并进行数据记录。我们将提供不同类型的SSR图谱示例,并指导读者如何识别和解读不同大小的条带,以及如何区分真实的SSR多态性与非特异性扩增产物。 第三部分:SSR标记在玉米品种DNA指纹鉴定中的应用 本部分将深入探讨SSR标记在玉米品种DNA指纹鉴定中的广泛应用,并结合实际案例进行详细阐述。 品种鉴定与识别: SSR标记能够提供高度特异性的DNA指纹,用于准确鉴定不同的玉米品种。我们将介绍如何构建品种特异性SSR位点数据库,以及如何利用这些数据库对未知样品进行品种鉴定。通过比较未知样品的SSR图谱与数据库中的标准图谱,可以快速、准确地确定其品种归属。 种质资源的管理与评估: 在种质资源库中,SSR指纹可以帮助科研人员对收集到的种质资源进行有效的分类、整理和管理。它能够揭示种质资源间的亲缘关系,评估遗传多样性水平,为育种计划提供重要的遗传信息。我们将介绍如何利用SSR数据评估种质资源的重复性,以及如何筛选具有独特遗传背景的种质。 种子纯度检测: 种子纯度直接关系到农作物的产量和品质。SSR指纹技术可以有效检测种子的品种纯度,识别混杂的非目标品种。通过对一定数量的单株种子进行SSR基因分型,可以判断种子的品种纯度是否达到国家标准或育种目标。 知识产权保护: SSR指纹为玉米品种的知识产权保护提供了有力的技术支持。每个品种都拥有其独特的SSR指纹,可以作为品种权归属的法律证据。本书将探讨如何利用SSR指纹进行品种侵权鉴定,维护育种者的合法权益。 分子标记辅助育种: 虽然本书主要聚焦于DNA指纹鉴定,但SSR标记在其他分子标记辅助育种应用中也发挥着重要作用。例如,SSR标记可以与目标性状(如产量、抗病性、耐逆性等)关联,用于标记辅助选择。本书将简要提及SSR标记在这些方面的潜力。 第四部分:SSR标记技术的挑战与发展趋势 在总结SSR标记在玉米品种DNA指纹鉴定中的优势的同时,本书也将客观分析其面临的挑战。例如,SSR标记的开发需要消耗一定的时间和资源,引物设计和优化也需要一定的技术经验。不同实验室之间由于仪器、试剂和操作流程的差异,可能导致SSR图谱的比较和解读存在一定的难度。 展望未来,本书将探讨SSR标记与其他分子标记技术(如AFLP, RFLP, ISSR, SNP等)的结合应用,以及高通量测序技术(如RAD-seq, GBS等)对传统SSR标记的补充和替代。我们将重点关注SSR标记在精准育种、基因组辅助选择等前沿领域的潜在应用,以及未来SSR技术的发展方向,例如开发更高通量、更经济、更智能化的SSR检测平台。 结论 《玉米品种DNA指纹鉴定技术:SSR标记的研究与应用》一书,以其严谨的科学态度、详实的实验指导和丰富的应用案例,为广大读者提供了一部关于玉米SSR标记DNA指纹鉴定的权威参考。本书不仅梳理了SSR标记的核心理论与技术,更将其与玉米品种鉴定的实际需求紧密结合,展示了其在农业生产、科研育种和知识产权保护等方面的巨大价值。通过学习本书,读者将能够掌握SSR标记技术在玉米品种DNA指纹鉴定中的应用,为推动玉米育种的现代化和可持续发展贡献力量。

用户评价

评分

这本名为《玉米品种DNA指纹鉴定技术:SSR标记的研究与应用》的书籍,显然是面向科研人员和农业技术人员的专业著作,它聚焦于现代分子生物学技术在玉米育种和品种管理中的具体应用。我个人作为一名对农业科技发展抱有浓厚兴趣的读者,在阅读它之后,深刻感受到其在技术深度和实践指导性上的巨大价值。书中对SSR(简单重复序列)标记原理的详尽阐述,以及如何将其系统性地应用于玉米品种的DNA指纹构建,为我们理解现代品种鉴定提供了坚实的理论基础。特别是作者对于实验流程的细致描述,从DNA提取的优化到PCR扩增条件的筛选,再到凝胶电泳或毛细管电泳后的数据分析,每一步骤都体现了严谨的科学态度。对于那些需要在分子标记辅助选择(MAS)中提高效率的育种工作者来说,这本书无疑是一本不可或缺的工具书,它不仅解释了“是什么”,更重要的是教会了我们“如何做”,将复杂的分子生物学技术转化为可操作的田间管理和品种验证手段。这种理论与实践紧密结合的编写方式,极大地拓宽了我在利用高通量分子数据进行决策的能力视野。

评分

读完这本关于玉米DNA指纹鉴定的著作,我最大的感受是其在推动我国玉米产业标准化和知识产权保护方面所蕴含的巨大潜力。书中对不同SSR位点在区分近缘或同源品种时的特异性分析,展现了技术人员在建立可靠鉴定体系时所付出的努力。例如,书中对“假阳性”或“标记共显性”等常见问题的案例剖析,帮助读者预判在实际操作中可能遇到的障碍,并提供了相应的解决方案或替代策略。这种前瞻性的视角,使得本书不仅仅是一本技术手册,更像是一份包含了多年实践经验的“避坑指南”。对于涉及品种权纠纷的法律或知识产权领域人士而言,书中提供的标准化的鉴定流程和结果解释方法,可以作为重要的技术参考依据。它使得“品种”这个概念从传统的形态学描述,一跃进入到精准的基因组学层面,为品种的认定和保护提供了强有力的科学支撑,极大地提升了我国在玉米新品种保护领域的国际竞争力。

评分

这本书在结构编排上,遵循了从宏观理论到微观操作的清晰逻辑,这对于初次接触SSR标记技术的研究生或青年科研人员非常友好。它没有陷入过度深奥的生化细节中,而是巧妙地将核心的分子生物学原理,例如SSR的微卫星特性、引物设计准则等,融入到实际的玉米基因组背景下进行讲解。我特别欣赏其中关于数据分析和结果解读的章节,作者们不仅展示了如何生成清晰的电泳图谱,更重要的是教会读者如何将这些条带模式转化为具有生物学意义的品种“指纹”。对于如何建立和维护一个包含数百个标准品种的参考文库,书中的建议具有很高的操作价值。这套系统的指纹库一旦建立,未来任何新收集的玉米材料,都可以快速、客观地与其进行比对,极大地缩短了新品种的鉴定周期,这对于竞争日益激烈的现代农业科技前沿无疑是至关重要的速度优势。

评分

从技术更新的角度来看,这本书无疑站在了分子标记技术发展的前沿,尽管SSR技术已经发展多年,但书中对如何结合更新的数据处理工具来提高分析效率的探讨,显示出作者紧跟时代步伐。它不仅关注了传统凝胶电泳的结果分析,还暗示或直接提及了毛细管电泳数据处理软件的应用,这对于需要处理大量样本的实验室至关重要。更深层次的,这本书成功地搭建起了一座桥梁,连接了基础的分子生物学研究与直接的农业生产实践。它清晰地论证了为什么精确的品种鉴定不再是可选项,而是现代商业化育种的必需品。例如,在种子质量监管、杂交种的纯度检测等方面,DNA指纹技术提供了传统方法无法比拟的精准度和可重复性。这本书的出版,标志着我国在利用高精度分子工具服务于传统作物改良方面,已达到一个成熟且可推广的阶段。

评分

我对本书的阅读体验是:这是一部知识密度极高,但表达又相当克制的专业教材。它避免了过度口语化带来的知识点松散,也避免了纯理论书籍带来的晦涩难懂。书中对SSR标记在玉米遗传多样性评估中的作用的讨论,具有极高的学术价值。作者没有仅仅停留在“鉴定”层面,而是深入探讨了如何利用这些指纹数据来指导种质资源的合理利用和保护。例如,如何利用指纹图谱来识别那些基因组结构独特、可能包含稀有优良等位基因的品种,从而避免因过度依赖少数几个“明星品种”而导致的遗传资源狭隘化。这种将品种鉴定与种质创新、资源保育相结合的综合性思考,体现了作者团队对农业可持续发展的深刻理解。对于希望深入了解玉米遗传多样性与育种策略间关系的学者来说,这本书提供了扎实的分子证据和清晰的分析框架。

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